Z/X: Код воссоединения

После длительной войны между людьми и зексами, которые пришли из пяти параллельных миров, наступило хрупкое перемирие. Теперь судьба миров зависит от маленькой, но решительной девочки по имени Адзуми Кагамихара и её партнёра, хладнокровного зекса из Голубого Мира по имени Ригель. Они отправляются в Академию Фудзимисаки, специальную школу, где готовят подобные пары человека и зекса. В этой академии Адзуми знакомится с другими девочками, которые также стремятся к миру и гармонии между мирами. Вместе они пройдут через множество испытаний и тренировок, чтобы обрести силу и понимание, необходимые для сохранения мира. Адзуми и её друзья учатся не только сражаться, но и доверять друг другу, объединяться в едином стремлении защитить свои миры от новой угрозы.